Joint table (phenotype + alignment) for analyzed recombinants. Note, that alignment is fragmented into blocks of 20 amino acids each in the same way as for recombination analysis table. Dowload MS excel version of this table here. Non fragmented alignment can be dowloaded here.

Clone_ID	y_EV22	y_AvrPto22	y_AvrPtoB22	y_EV28	y_AvrPto28	y_AvrPtoB28	pl_no_DEX	pl_with_DEX	1_20	21_40	41_60	61_80	81_100	101_120	121_140	141_160	161_180	181_200	201_220	221_240	241_260	261_280	281_300	301_320	321-337
Pto	0	1	1	0	1	1	0	4	MGSKYSKATNSINDALSSSY	LVPFESYRVPLVDLEEATNN	FDHKFLIGHGVFGKVYKGVL	RDGAKVALKRRTPESSQGIE	EFETEIETLSFCRHPHLVSL	IGFCDERNEMILIYKYMENG	NLKRHLYGSDLPTMSMSWEQ	RLEICIGAARGLHYLHTRAI	IHRDVKSINILLDENFVPKI	TDFGISKKGTELDQTHLSTV	VKGTLGYIDPEYFIKGRLTE	KSDVYSFGVVLFEVLCARSA	IVQSLPREMVNLAEWAVESH	NNGQLEQIVDPNLADKIRPE	SLRKFGDTAVKCLALSSEDR	PSMGDVLWKLEYALRLQESV	I----------------
Fen	1	1	1	1	1	1	4	4	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	......CT............	.......TMP..........	.R.NI...A...ALW.Q...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..............C...PT	.QDDPE-----------
Pth2	0	0	0	0	0	0	0	0	..TN...P.T.....SNL.N	R.....F...F...Q.....	..D.....V.I...D.R...	...T......HK...P....	..R....I..H.S.......	..Y...........E.....	..SKR......CLPT.....	................NS.V	..C....T.........A..	.......TTP.F........	.Q.SI.........R.Q..K	..................P.	.GR.---H.IS.......TQ	KM.........TIVA.....	...M..E...N...S...N.	..................PI	.QDNPE-----------
Pth3	0	0	0	0	0	0	4	4	............S..SN.R.	G....N..............	..DN.F.AE.G.....R...	...T......HNCD.Q.S..	..R....I..RRS.......	..Y..G........D.....	...S........--......	.................NGV	M......S............	....L..TRPQ.Y...V..D	....F...............	....................	......S.............	........I.....A.....	......E.............	....................	.----------------
Pth4	0	0	0	0	0	0	0	0	.R..D..E.TY.S.TT--..	RF.V..SQI.FAA.Q.....	.NCNS...L.G..T..R...	C..T......CKL.......	..Q....M..HF...Y....	..Y...N.VT...F......	S.SS.....Y..--T.T...	............Y...KN.V	.......A.........A.T	....V..TR.......V...	.......L....V.R.K...	............K.......	..HYISKGL.T..A..MD..	KK............S....K	Y.N...E.......D.GV..	..V....-------------	-----------------
clone257	0	1	1	0	1	1	4	3	....................	..........F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T.....KHK........	............S.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	.......A............	....L..TRPQ.Y...V..D	....F...............	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E.............	..................PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone264	-1	-1	-1	-1	-1	-1	-1	-1	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I..RRS.......	..............D.....	............--......	.................NGV	M......S............	.......TMP......V...	....................	....................	......S.............	...........TI.A.....	...M..E.............	..................PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone268	1	1	1	1	1	1	-1	-1	.R.............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....G...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	.................NGV	M......S.........A.T	................V...	....F...............	....................	......S.............	........I...........	......E.............	....................	.----------------
clone272	0	1	1	0	1	1	0	4	.............N.SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T......HK........	.......I....S.......	.....G..............	............--......	............Y...KN.V	....................	....................	....................	....................	....................	...........TI.A.....	.........I....P..KN.	..............C...PT	.QDDPE-----------
clone274	-1	-1	-1	-1	-1	-1	0	0	............S..SN.R.	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	.........KHK........	.......I............	..............D.....	S.SS.....Y..--T.T...	....................	....................	................V..D	....F...............	..................P.	L...................	..............A.....	............S.......	....................	.----------------
clone277	0	1	1	0	1	1	0	0	............S..SN.R.	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..Y..G........D.....	...S.....Y..--T.T...	..G.............KN.V	......CT............	....................	....F...............	....................	................MD..	KK............A.....	......E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone279	0	1	1	0	1	1	0	4	...............SNL..	G....N..............	..DN.F.AE.G.....R...	C..T......CK........	............S.......	........G.....D.....	...S........--......	................KN.V	.......A.........A.T	....V..TR.......V...	....................	..................P.	L.....S.............	KK.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone280	0	1	1	0	1	1	0	0	............S..SN.R.	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	..R....I..RRS.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	.......A............	.......TR.......V...	....................	....................	....................	....................	...M..E..I....P..KN.	..............C...PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone281	0	1	0	0	1	0	0	0	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T......HK........	.......I............	..............D.....	...S........--......	................KN.V	......CT............	.......TMP..........	.R..................	....................	....................	..............A.....	......E.......D.GV..	..V.................	.----------------
clone282	0	1	0	0	1	0	0	0	............S..SN.R.	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	............S.......	.....G........D.....	...S........--P.....	............Y...KN.V	.......A............	....................	....F.......V.R.K...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM............A.....	..G...E.............	....................	.----------------
clone283	0	1	1	0	1	1	0	0	...............SNLR.	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.........	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	....................	....................	....L..TR.......V..D	....F...A...ALW.Q.A.	....................	......S.............	..............A.....	...M..E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone285	0	1	0	0	1	0	0	0	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T......HK........	..Q....I....S.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	.................A.T	....L..TRPQ.Y...V...	....F...............	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KMR........TI.A.....	....................	....................	.----------------
clone287	-1	-1	-1	-1	-1	-1	0	0	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	.....G........D.....	...S........--......	................KN.V	....................	................V..D	....F...............	....................	......S.............	..............A.....	....................	....................	.----------------
clone290	0	0	0	0	0	0	0	0	...............SNL..	G....N..............	..DN.F..E.G.....R...	...T................	.......I....S.......	..............D.....	...S.....Y..--......	....................	.......A............	...................D	....F...............	....................	......S.............	..............S....R	Y.N...E.............	....................	.----------------
clone297	0	1	1	0	1	1	4	4	............S..SN.R.	G....N..............	..DN.F..E.G.....R...	...T................	....................	..............D.....	....................	................KN.V	.......S............	.......TRPQ.Y...V..D	....F...........Q...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..................PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone299	1	1	1	1	1	1	0	0	...............SNL..	G...................	..DN.F.AE.G.....R...	...T......HK........	.......I....S.......	..Y..G........D.....	...S................	.................NGV	M......A............	.......TMP..........	....................	....................	..HYISKGL.T..A..MD..	KK.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone300	0	1	1	0	1	1	0	0	.R.............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S.....Y..--T.T...	....................	....................	....................	A...................	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	......E..I....P..KN.	..............C.....	.----------------
clone302	0	1	0	0	1	0	0	0	....................	..........F...Q.....	.NCNS...L.G..T..R...	C..T......CKL.......	..R....I....S.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	....................	................V...	.......L....V.R.K...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........T..A.....	...M..E.............	....N.........C...PT	.QDDPE-----------
clone303	0	1	1	0	1	1	4	4	...............SNL..	G....N....F.........	..........G..T..R...	...T.I...KHK........	......GI............	..............D.....	...S........--......	............Y...KN.V	M......S............	.......TRPQ.Y...V..D	....F...............	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM..................	....................	..............C.....	.----------------
clone305	-1	-1	-1	1	1	1	0	0	....................	.....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..Y..G........D.....	...S........--......	....................	....................	....................	....F...............	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone306	0	1	1	0	1	1	0	4	............S..SN.R.	G...................	....................	....................	............S.......	..Y..G........D.....	...S........--......	............Y...KN.V	.......A............	....................	....................	....................	....................	........I.....A.....	......E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone312	0	1	1	0	1	1	0	4	...............SNL..	G...................	..DN.F.AE.G.....R...	...T......HK........	............S.......	..............D.....	...S.....Y..--T.T...	.................NGV	M......S............	................V...	....F..L....V.R.K...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	......E.............	..................PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone322	0	1	0	0	1	0	0	0	............S..SN.R.	G....N..............	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..Y.................	...S........--......	............Y...KN.V	....................	....................	.R..................	..................P.	..HYISKGL.T..A..MD..	KK............A.....	......E.............	..........G.........	.----------------
clone331	0	0	0	0	0	0	0	0	.......E....S..SN.R.	G....N..............	I.DN.F.AE.G.........	..........HNCD.Q.S..	..R....I....S.......	..............D.....	...S........--......	....................	....................	....................	....F...............	............K.....P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..........D.GV..	..V....-------------	-----------------
clone334	0	1	1	0	1	1	0	0	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T.....KHK........	.......I..RRS.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	....................	.......TMP..........	....................	..................P.	......S.............	...........TI.A.....	......E.............	..............C...PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone339	1	1	1	1	1	1	0	0	............S..SN.R.	G.L..N..............	..DN.F..E.G.....R...	...T......HK........	..Q....M..RRS.......	..Y..G........D.....	....................	............Y...KN.V	....................	....................	............V.R.K...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..............C.....	.----------------
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clone369	0	0	0	0	0	0	0	0	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T................	.......I....S.......	..............D.....	............--......	............Y...KN.V	......CT............	................V...	.......L............	............K.......	....................	..............A.....	Y.N...E.............	....................	.----------------
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clone386	1	1	1	1	1	1	0	0	...............SN.R.	G....N..............	..DN.F..E.G.........	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	.................NGV	M......S............	................V..D	....F...............	....................	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..............C...PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone401	0	1	1	0	1	1	0	0	....................	G....N....F.........	........Q.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S..Y....	..............D.....	...S........--......	.................NGV	M......S............	....L..TRPQ.Y...V...	.......L....V.R.K...	....................	..HYISKGL.T..A..MD..	KK..................	......E.......P..KN.	....................	.----------------
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clone429	0	1	1	1	1	1	0	0	............S..SN.R.	G...................	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	.................NGV	M...................	....................	....................	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..........G...C...PT	.QDDPE-----------
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clone438	-1	-1	-1	-1	-1	-1	0	0	............S..SN.R.	G....N..............	..DN.F.AE.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	V.............D.....	.........Y..--T.T...	.................NGV	M......S............	.......TR.......V..D	....................	....................	..HYISKGL.T..A..MD..	KK......I..TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	....................	.----------------
clone439	-1	-1	-1	-1	-1	-1	0	0	............S..SN.R.	G....N..............	..DN.F..E.G.....R...	.........KHK........	..Q......P..S.......	..............D.....	...S........--..G...	....................	....................	....................	.......L....V.R.K...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M................	..............C...PT	.QDDPE-----------
clone440	1	1	1	1	1	1	0	0	......R........SNL..	G....N....F...Q.....	.NCNS...L.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	S.SS.....Y..--T.T...	.................NGV	M......S............	....L..TRPQ.........	.R..........ALW.Q...	..................P.	LDR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..............C...PT	.QDDPE-----------
clone441	0	1	1	0	1	1	4	4	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F.AE.G.....R...	...T.....KHK........	..R....I..RRS.......	..............D.....	...S................	................KN.V	....................	....................	............ALW.Q...	..................P.	.DR.---.IMS.DD---.TQ	KM.........TI.A.....	......E.............	....................	.----------------
clone442	1	1	1	1	1	1	4	4	...............SNL..	G....N....F.........	..DN.F..G.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	..............D.....	...S........--......	................KN.V	....................	................V...	.......L............	..................P.	LDR.---.IMS.DD---...	...........TI.A.....	...M..E..I....P..KN.	..............C.....	.----------------
clone443	-1	-1	-1	-1	-1	-1	-1	-1	.......V....S..SN.R.	G....N....F.........	..DN.F..E.G.....R...	...T.....KHK........	.......I....S.......	....................	...S........--......	....................	....................	.......TMP..........	....................	....................	......S.............	...........TI.A.....	...M................	..............C...PT	.QDDPDETQLSCTKLAL
clone444	0	1	0	0	1	0	-1	-1	............S..SN...	G....N....F.........