Joint table (phenotype + alignment) for analyzed recombinants. Note, that alignment is fragmented into blocks
of 20 amino acids each in the same way as for recombination analysis table. Dowload MS excel version of
this table here. Non fragmented alignment can
be dowloaded here.
| Clone_ID |
y_EV22 |
y_AvrPto22 |
y_AvrPtoB22 |
y_EV28 |
y_AvrPto28 |
y_AvrPtoB28 |
pl_no_DEX |
pl_with_DEX |
1_20 |
21_40 |
41_60 |
61_80 |
81_100 |
101_120 |
121_140 |
141_160 |
161_180 |
181_200 |
201_220 |
221_240 |
241_260 |
261_280 |
281_300 |
301_320 |
321-337 |
| Pto |
0 |
1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
4 |
MGSKYSKATNSINDALSSSY |
LVPFESYRVPLVDLEEATNN |
FDHKFLIGHGVFGKVYKGVL |
RDGAKVALKRRTPESSQGIE |
EFETEIETLSFCRHPHLVSL |
IGFCDERNEMILIYKYMENG |
NLKRHLYGSDLPTMSMSWEQ |
RLEICIGAARGLHYLHTRAI |
IHRDVKSINILLDENFVPKI |
TDFGISKKGTELDQTHLSTV |
VKGTLGYIDPEYFIKGRLTE |
KSDVYSFGVVLFEVLCARSA |
IVQSLPREMVNLAEWAVESH |
NNGQLEQIVDPNLADKIRPE |
SLRKFGDTAVKCLALSSEDR |
PSMGDVLWKLEYALRLQESV |
I---------------- |
| Fen |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
4 |
4 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
......CT............ |
.......TMP.......... |
.R.NI...A...ALW.Q... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
..............C...PT |
.QDDPE----------- |
| Pth2 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
..TN...P.T.....SNL.N |
R.....F...F...Q..... |
..D.....V.I...D.R... |
...T......HK...P.... |
..R....I..H.S....... |
..Y...........E..... |
..SKR......CLPT..... |
................NS.V |
..C....T.........A.. |
.......TTP.F........ |
.Q.SI.........R.Q..K |
..................P. |
.GR.---H.IS.......TQ |
KM.........TIVA..... |
...M..E...N...S...N. |
..................PI |
.QDNPE----------- |
| Pth3 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
4 |
4 |
............S..SN.R. |
G....N.............. |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T......HNCD.Q.S.. |
..R....I..RRS....... |
..Y..G........D..... |
...S........--...... |
.................NGV |
M......S............ |
....L..TRPQ.Y...V..D |
....F............... |
.................... |
......S............. |
........I.....A..... |
......E............. |
.................... |
.---------------- |
| Pth4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
.R..D..E.TY.S.TT--.. |
RF.V..SQI.FAA.Q..... |
.NCNS...L.G..T..R... |
C..T......CKL....... |
..Q....M..HF...Y.... |
..Y...N.VT...F...... |
S.SS.....Y..--T.T... |
............Y...KN.V |
.......A.........A.T |
....V..TR.......V... |
.......L....V.R.K... |
............K....... |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
KK............S....K |
Y.N...E.......D.GV.. |
..V....------------- |
----------------- |
| clone257 |
0 |
1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
4 |
3 |
.................... |
..........F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T.....KHK........ |
............S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.......A............ |
....L..TRPQ.Y...V..D |
....F............... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E............. |
..................PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone264 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I..RRS....... |
..............D..... |
............--...... |
.................NGV |
M......S............ |
.......TMP......V... |
.................... |
.................... |
......S............. |
...........TI.A..... |
...M..E............. |
..................PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone268 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
-1 |
-1 |
.R.............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....G... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................NGV |
M......S.........A.T |
................V... |
....F............... |
.................... |
......S............. |
........I........... |
......E............. |
.................... |
.---------------- |
| clone272 |
0 |
1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
4 |
.............N.SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T......HK........ |
.......I....S....... |
.....G.............. |
............--...... |
............Y...KN.V |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
...........TI.A..... |
.........I....P..KN. |
..............C...PT |
.QDDPE----------- |
| clone274 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
0 |
0 |
............S..SN.R. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
.........KHK........ |
.......I............ |
..............D..... |
S.SS.....Y..--T.T... |
.................... |
.................... |
................V..D |
....F............... |
..................P. |
L................... |
..............A..... |
............S....... |
.................... |
.---------------- |
| clone277 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
............S..SN.R. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..Y..G........D..... |
...S.....Y..--T.T... |
..G.............KN.V |
......CT............ |
.................... |
....F............... |
.................... |
................MD.. |
KK............A..... |
......E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone279 |
0 |
1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
4 |
...............SNL.. |
G....N.............. |
..DN.F.AE.G.....R... |
C..T......CK........ |
............S....... |
........G.....D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.......A.........A.T |
....V..TR.......V... |
.................... |
..................P. |
L.....S............. |
KK.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone280 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
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............S..SN.R. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
..R....I..RRS....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.......A............ |
.......TR.......V... |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
...M..E..I....P..KN. |
..............C...PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
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0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T......HK........ |
.......I............ |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
......CT............ |
.......TMP.......... |
.R.................. |
.................... |
.................... |
..............A..... |
......E.......D.GV.. |
..V................. |
.---------------- |
| clone282 |
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0 |
0 |
1 |
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0 |
0 |
............S..SN.R. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
............S....... |
.....G........D..... |
...S........--P..... |
............Y...KN.V |
.......A............ |
.................... |
....F.......V.R.K... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM............A..... |
..G...E............. |
.................... |
.---------------- |
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1 |
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...............SNLR. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G......... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................... |
.................... |
....L..TR.......V..D |
....F...A...ALW.Q.A. |
.................... |
......S............. |
..............A..... |
...M..E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone285 |
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1 |
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0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T......HK........ |
..Q....I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.................A.T |
....L..TRPQ.Y...V... |
....F............... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KMR........TI.A..... |
.................... |
.................... |
.---------------- |
| clone287 |
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-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
-1 |
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0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
.....G........D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.................... |
................V..D |
....F............... |
.................... |
......S............. |
..............A..... |
.................... |
.................... |
.---------------- |
| clone290 |
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0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
...............SNL.. |
G....N.............. |
..DN.F..E.G.....R... |
...T................ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S.....Y..--...... |
.................... |
.......A............ |
...................D |
....F............... |
.................... |
......S............. |
..............S....R |
Y.N...E............. |
.................... |
.---------------- |
| clone297 |
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1 |
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1 |
1 |
4 |
4 |
............S..SN.R. |
G....N.............. |
..DN.F..E.G.....R... |
...T................ |
.................... |
..............D..... |
.................... |
................KN.V |
.......S............ |
.......TRPQ.Y...V..D |
....F...........Q... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
..................PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone299 |
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1 |
1 |
1 |
1 |
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...............SNL.. |
G................... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T......HK........ |
.......I....S....... |
..Y..G........D..... |
...S................ |
.................NGV |
M......A............ |
.......TMP.......... |
.................... |
.................... |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
KK.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone300 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
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.R.............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S.....Y..--T.T... |
.................... |
.................... |
.................... |
A................... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
......E..I....P..KN. |
..............C..... |
.---------------- |
| clone302 |
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1 |
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0 |
1 |
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0 |
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.................... |
..........F...Q..... |
.NCNS...L.G..T..R... |
C..T......CKL....... |
..R....I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.................... |
................V... |
.......L....V.R.K... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........T..A..... |
...M..E............. |
....N.........C...PT |
.QDDPE----------- |
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0 |
1 |
1 |
4 |
4 |
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G....N....F......... |
..........G..T..R... |
...T.I...KHK........ |
......GI............ |
..............D..... |
...S........--...... |
............Y...KN.V |
M......S............ |
.......TRPQ.Y...V..D |
....F............... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.................. |
.................... |
..............C..... |
.---------------- |
| clone305 |
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-1 |
-1 |
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1 |
1 |
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0 |
.................... |
.....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..Y..G........D..... |
...S........--...... |
.................... |
.................... |
.................... |
....F............... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone306 |
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1 |
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G................... |
.................... |
.................... |
............S....... |
..Y..G........D..... |
...S........--...... |
............Y...KN.V |
.......A............ |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
........I.....A..... |
......E..I....P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone312 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
4 |
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G................... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T......HK........ |
............S....... |
..............D..... |
...S.....Y..--T.T... |
.................NGV |
M......S............ |
................V... |
....F..L....V.R.K... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
......E............. |
..................PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
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1 |
0 |
0 |
1 |
0 |
0 |
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G....N.............. |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..Y................. |
...S........--...... |
............Y...KN.V |
.................... |
.................... |
.R.................. |
..................P. |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
KK............A..... |
......E............. |
..........G......... |
.---------------- |
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0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
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G....N.............. |
I.DN.F.AE.G......... |
..........HNCD.Q.S.. |
..R....I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................... |
.................... |
.................... |
....F............... |
............K.....P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..........D.GV.. |
..V....------------- |
----------------- |
| clone334 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
0 |
0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I..RRS....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.................... |
.......TMP.......... |
.................... |
..................P. |
......S............. |
...........TI.A..... |
......E............. |
..............C...PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone339 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
............S..SN.R. |
G.L..N.............. |
..DN.F..E.G.....R... |
...T......HK........ |
..Q....M..RRS....... |
..Y..G........D..... |
.................... |
............Y...KN.V |
.................... |
.................... |
............V.R.K... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
..............C..... |
.---------------- |
| clone367 |
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1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
-1 |
-1 |
.R..D..E.TY.S.TT--.. |
RF.V..SQI.FAA.Q..... |
.NCNS...L.G..T..R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
........I........... |
.................... |
.................... |
.---------------- |
| clone369 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
...T................ |
.......I....S....... |
..............D..... |
............--...... |
............Y...KN.V |
......CT............ |
................V... |
.......L............ |
............K....... |
.................... |
..............A..... |
Y.N...E............. |
.................... |
.---------------- |
| clone379 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
3 |
.................... |
.....N.............. |
..DN.F..E.G.....R... |
.........KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................... |
.................... |
.................... |
.................... |
.......S..........P. |
......S............. |
........I........... |
......E..I.......... |
..............C...PT |
.QDDPE----------- |
| clone386 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
...............SN.R. |
G....N.............. |
..DN.F..E.G......... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................NGV |
M......S............ |
................V..D |
....F............... |
.................... |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
..............C...PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone401 |
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1 |
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1 |
1 |
0 |
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.................... |
G....N....F......... |
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...T.....KHK........ |
.......I....S..Y.... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................NGV |
M......S............ |
....L..TRPQ.Y...V... |
.......L....V.R.K... |
.................... |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
KK.................. |
......E.......P..KN. |
.................... |
.---------------- |
| clone423 |
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1 |
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0 |
1 |
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G....N....F......... |
.................... |
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..R....I..RRS....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................... |
.................... |
................P... |
.................... |
.................... |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
KK............A..... |
.................... |
..............C..... |
.---------------- |
| clone426 |
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1 |
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.R.............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F.AE.G.....R... |
.........KHK........ |
.......I............ |
..............D..... |
...S........--...... |
................KN.V |
.......A............ |
................V... |
....F............... |
.................... |
.................... |
...P.......TIVA..... |
...M..E..I....P..KN. |
....G.............PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone427 |
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1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
...............SNL.. |
G....N....F......... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
............--...... |
............Y...KN.V |
.......S............ |
.................... |
.................... |
.................... |
..HYISKGL.T..A..MD.. |
........I.....A..... |
......E............. |
.................... |
.---------------- |
| clone428 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
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...............SNL.. |
G....N....F...Q..... |
.NCNS...L.G..T..R... |
C..T.....KHK........ |
.................... |
.................... |
...S........--...... |
.................NGV |
M......S............ |
.................... |
.................... |
............K....... |
......S............. |
..............A..... |
...R..E............. |
....G.........C...PT |
.QDDPDETQLSCTKLAL |
| clone429 |
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1 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
............S..SN.R. |
G................... |
..DN.F..E.G.....R... |
...T.....KHK........ |
.......I....S....... |
..............D..... |
...S........--...... |
.................NGV |
M................... |
.................... |
.................... |
..................P. |
LDR.---.IMS.DD---.TQ |
KM.........TI.A..... |
...M..E..I....P..KN. |
..........G...C...PT |
.QDDPE----------- |
| clone430 |
0 |
1 |
1 |
0 |
1 |
1 |
4 |
4 |
............S..SN.R. |
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